O sequenciamento de nova geração (Next Generation Sequencing – NGS) gera milhões de sequências em uma única corrida, possibilitando análises profundas e detalhadas de genomas, transcriptomas, metagenomas e comunidades microbianas a um custo baixo relativo ao volume de dados gerado.
Na BioSeq, oferecemos diferentes modalidades de NGS, com foco em projetos personalizados e suporte completo em todas as etapas — do desenho experimental à análise bioinformática:
Sequenciamento com reads curtas (Short read sequencing)
As tecnologias NGS de short reads geram leituras curtas, com até 300 pares de base. São ideais para o sequenciamento de amplicons (16S, 18S, ITS), metagenomas, transcriptomas, e para o sequenciamento parcial ou superficial de genomas (genome skimming) . As short reads são a melhor ferramenta para projetos de DNA ambiental (eDNA) e representam uma excelente alternativa para sequenciamento completo de pequenos genomas, como os de vírus, organelas (mitocôndrias e cloroplastos) e procariotos.
Sequenciamento de Amplicons (Illumina)
O sequenciamento de amplicons é focado na análise de marcadores, que são regiões específicas do genoma. Exemplos de marcadores são regiões dos genes 16S, 18S ou ITS. É uma técnica precisa, econômica e amplamente utilizada na identificação de micro- e macro-organismos. Se destacam como características:
- Custo reduzido em relação a outras formas de sequenciamento
- Marcadores específicos permitem a detecção de diferentes grupos biológicos
- Grande aplicação em estudo de microbiomas, DNA ambiental (eDNA) e ecologia microbiana, entre outros
Sequenciamento Shotgun (Illumina)
O sequenciamento shotgun consiste na fragmentação aleatória do DNA genômico, seguido da leitura dos fragmentos por NGS. Essa técnica permite:
- Sequenciamento genômico completo de organismos conhecidos ou não modelados
- Metagenômica shotgun de comunidades ambientais (microbiomas)
- Análises funcionais e taxonômicas simultaneamente
- Estimativas de abundância genética e variação intraespecífica
É uma abordagem poderosa para quem busca montagem de genomas completos, detecção de variantes, ou investigação do conteúdo genético em amostras ambientais ou clínicas. Ideal para estudos sem marcador específico e análise abrangente do material genético.
Sequenciamento com reads longas (Long read sequencing)
As tecnologias NGS de long reads geram leituras longas, muitas vezes com milhares de pares de bases. São ideais para a montagem de genomas maiores e para o sequenciamento de genomas que possuem regiões muito repetitivas, visto que as mesmas não podem ser resolvidas satisfatoriamente com reads curtas.
Dúvidas sobre os nossos serviços ou sobre qual metodologia de sequenciamento é mais indicada para o seu projeto? Fale com a gente.